Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ARCN1P48444 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms