Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PIP4K2AP48426 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms