Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GRIA4P48058 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms