Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNJ1P48048 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNJ1P48048 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms