Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GNPDA1P46926 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms