Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTR1BP42025 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACTR1BP42025 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ACTR1BP42025 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.7 ms