Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SPRR1AP35321 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms