Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2H1P32780 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2H1P32780 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms