Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HOXC13P31276 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms