Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXA13P31271 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms