Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF2E1P29083 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2E1P29083 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms