Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PLNP26678 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PLNP26678 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PLNP26678 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PLNP26678 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PLNP26678 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PLNP26678 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PLNP26678 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PLNP26678 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PLNP26678 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PLNP26678 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PLNP26678 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PLNP26678 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PLNP26678 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PLNP26678 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
PLNP26678 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PLNP26678 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
PLNP26678 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
PLNP26678 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PLNP26678 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PLNP26678 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PLNP26678 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PLNP26678 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PLNP26678 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PLNP26678 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PLNP26678 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PLNP26678 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PLNP26678 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms