Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS6KB1P23443 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms