Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMD1P17707 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMD1P17707 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMD1P17707 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMD1P17707 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMD1P17707 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMD1P17707 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMD1P17707 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMD1P17707 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMD1P17707 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMD1P17707 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMD1P17707 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMD1P17707 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMD1P17707 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMD1P17707 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMD1P17707 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMD1P17707 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMD1P17707 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AMD1P17707 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMD1P17707 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms