Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CFTRP13569 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CFTRP13569 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CFTRP13569 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CFTRP13569 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CFTRP13569 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFTRP13569 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFTRP13569 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFTRP13569 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFTRP13569 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFTRP13569 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFTRP13569 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CFTRP13569 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFTRP13569 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CFTRP13569 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFTRP13569 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFTRP13569 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFTRP13569 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFTRP13569 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFTRP13569 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFTRP13569 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFTRP13569 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFTRP13569 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFTRP13569 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFTRP13569 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFTRP13569 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CFTRP13569 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFTRP13569 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms