Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACTN1P12814 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms