Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PKHD1P08F94 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
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