Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYBBP04839 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYBBP04839 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYBBP04839 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYBBP04839 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYBBP04839 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYBBP04839 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYBBP04839 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYBBP04839 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYBBP04839 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYBBP04839 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYBBP04839 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYBBP04839 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYBBP04839 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms