Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
C6orf47O95873 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms