Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSVO60911 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSVO60911 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSVO60911 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSVO60911 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSVO60911 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSVO60911 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSVO60911 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSVO60911 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSVO60911 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSVO60911 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSVO60911 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSVO60911 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms