Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPAG9O60271 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
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