Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms