Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
J3QRK9 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
J3QRK9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
J3QRK9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
J3QRK9 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
J3QRK9 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3QRK9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3QRK9 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3QRK9 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3QRK9 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3QRK9 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3QRK9 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3QRK9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3QRK9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3QRK9 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3QRK9 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3QRK9 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3QRK9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3QRK9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
J3QRK9 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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