Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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USP17L12C9JPN9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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USP17L12C9JPN9 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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USP17L12C9JPN9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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USP17L12C9JPN9 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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USP17L12C9JPN9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
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