Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TUSC5-201ENST00000333813 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 RBFOX1-208ENST00000547372 3524 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 NDRG4-204ENST00000394282 3626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VGLL3A8MV65 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms