Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAF6Q9Y4K3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms