Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERVW-1Q9UQF0 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms