Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SHANK2Q9UPX8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SHANK2Q9UPX8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms