Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAK1Q9UPV9 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAK1Q9UPV9 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1636.6 ms