Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TUBE1Q9UJT0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TUBE1Q9UJT0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms