Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYTH4Q9UIA0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms