Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MLH3Q9UHC1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MLH3Q9UHC1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms