Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
DKK2Q9UBU2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms