Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms