Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RNF7Q9UBF6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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