Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COPG2Q9UBF2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms