Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HCN3Q9P1Z3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms