Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGEF38Q9NXL2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGEF38Q9NXL2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGEF38Q9NXL2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGEF38Q9NXL2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGEF38Q9NXL2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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ARHGEF38Q9NXL2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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ARHGEF38Q9NXL2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ARHGEF38Q9NXL2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ARHGEF38Q9NXL2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ARHGEF38Q9NXL2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ARHGEF38Q9NXL2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ARHGEF38Q9NXL2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARHGEF38Q9NXL2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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