Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf42Q9NWW7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C2orf42Q9NWW7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms