Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FBXO28Q9NVF7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms