Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PKDREJQ9NTG1 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms