Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ARFGAP3Q9NP61 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms