Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPIFA1Q9NP55 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms