Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC96

CAPN10, Calpain-10, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN10Q9HC96 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPN10Q9HC96 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms