Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLSPNQ9HAW4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLSPNQ9HAW4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms