Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00597Q9H2U6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00597Q9H2U6 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms