Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SLIRPQ9GZT3 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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