Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM4Q9C037 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms