Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
POLDIP3Q9BY77 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms