Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms